REVISIONES

Shallot virus X: a hardly known pathogen of the genus Allium

Received June 08th 2018 // Accepted March 14th 2019// Published online June 10th 2020
GRANDA JARAMILLO, R.1 ; FLORES, F.2
ABSTRACT
 
Crops belonging to the genus Allium, family Amaryllidaceae, are economically important and are widely cultivated around the globe. Some of the most problematic diseases of these crops are caused by members of three virus genera, Potyvirus, Carlavirus and Allexivirus. Shallot virus X (ShVX) is an Allexivirus that was first discovered in Russia in the nineties and it has since been described worldwide. The virus, transmitted mechanically or by the dry bulb mite (Aceria tulipae), affects virtually all members of the genus Allium and it causes yield reductions on these crops. ShVX is a positive-sense single-stranded monopartite RNA virus that contains six open reading frames (ORFs). The virus is mainly detected by RT-PCR but there are other serological and molecular techniques available for diagnosis. There are no methods described for managing crops infected by ShVX in the field, but tissue culture of meristems can render virus-free plants. Research on the ShVX-Allium pathosystem is needed for a comprehensive understanding of the physiological and molecular mechanisms used by the virus to infect its hosts and for developing methods for the effective control of viral infections.
 
Keywords: Allexivirus, ShVX, RT-PCR, onion, garlic.
 
 
RESUMEN
 
Los cultivos del género Allium, familia Amaryllidaceae, son económicamente importantes y ampliamente sembrados alrededor del mundo. Algunas de las enfermedades más problemáticas de estos cultivos son ocasionadas por virus de tres géneros, Potyvirus, Carlavirus y Allexivirus. Shallot virus X (ShVX) es un Allexivirus que fue descrito por primera vez en Rusia en la década de los noventa y desde entonces se ha descrito su presencia a nivel mundial. El virus, transmitido mecánicamente o por el eriófido de los bulbos (Aceria tulipae), afecta prácticamente a todos los miembros del género Allium ocasionando la disminución en la producción de estos cultivos. ShVX tiene un genoma monopartito representado por una cadena simple de ARN de polaridad positiva con seis marcos abiertos de lectura (ORFs). El virus se detecta principalmente por RT-PCR, pero existen otros métodos serológicos y moleculares disponibles para su diagnóstico. No existen métodos descritos para el manejo de plantas infectadas con ShVX en el campo, sin embargo se ha determinado que el cultivo de tejidos meristemáticos puede producir plantas libres de virus. Es necesario desarrollar investigaciones en el patosistema ShVX-Allium para lograr un entendimiento general sobre los mecanismos fisiológicos y moleculares que utiliza el virus para infectar a su hospedero y para desarrollar métodos para el control efectivo de las infecciones virales.
 
Palabras clave: Allexivirus, ShVX, RT-PCR, cebolla, ajo.
 
Universidad UTE, Facultad de Ciencias de la Ingeniería e Industrias, Quito, Ecuador. Correo electrónico: roberto.granda@ute.edu.ec
2 Centro de Investigación de Alimentos, CIAL, Facultad de Ciencias de la Ingeniería e Industrias, Universidad UTE, 171029 Quito, Ecuador; Departamento de Ciencias de la Vida y la Agricultura, Universidad de las Fuerzas Armadas ESPE, 170501 Sangolquí, Ecuador.

Notas Actualidad I+D

  • Revista RIA publica el número de diciembre
    22 de December de 2020

    Con el tema de tapa enfocado en la resistencia antimicrobiana, especialistas de INTA y Senasa reconocen los riesgos del abuso y mal uso de los antibióticos en los animales de producción. Además, con la publicación de artículos científicos, se interpela el “agua invisible” como recurso estratégico y, en la entrevista, a la divulgación científica.

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  • El presidente Alberto Fernández premió a un investigador del INTA
    14 de December de 2020

    Fernando Andrade recibió el premio Houssay a la investigación de manos del presidente de la Nación por su aporte en el manejo de los cultivos extensivos que impulsaron mejores prácticas de cultivo agrícola en nuestro país. Se trata del máximo galardón que se entrega a la persona más sobresaliente del sistema científico nacional.

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  • 10 de December de 2020

    Las mismas se realizaron durante 8 meses de intenso trabajo a partir del convenio de colaboración para el diagnóstico de SARS-CoV-2 firmado con el Ministerio de Salud de la provincia de Buenos Aires. Se pusieron a disposición laboratorios y equipos de profesionales entrenados y calificados.

     

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  • El INTA será parte de la Reunión del Grupo de Trabajo del Proceso de Montreal
    03 de December de 2020

    Del 9 al 10 de diciembre, Argentina será anfitrión virtual de la vigésimo novena reunión que integra a las 12 naciones que contienen alrededor de 80 % de los bosques templados y boreales del mundo. Con la participación de los ministerios nacionales de Agricultura y Ambiente, el INTA asiste al proceso aportando información y acompañando al grupo de trabajo.

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